В соответствии с п. 4 ст. 170 НК РФ налогоплательщики обязаны вести раздельный учёт сумм НДС по приобретённым товарам (работам, услугам), в том числе основным средствам и нематериальным активам, имущественным правам, используемым для осуществления как облагаемых НДС, так и не подлежащих налогообложению (освобождаемых от налогообложения) операций. Особенностей ведения раздельного учёта налогоплательщиками, у которых доходы и расходы по деятельности, не облагаемой НДС, составляют более 95% общих доходов и расходов, не предусмотрено.
Абзац 8 п. 4 ст. 170 НК РФ при отсутствии у такого налогоплательщика раздельного учёта суммы НДС по приобретённым товарам вычету не подлежат.
Такое разъяснение содержится в Письме Минфина от 03.08.2009 № 03-07-07/60.