В соответствии с подп. 1 п. 1 ст. 220 НК РФ налогоплательщик при определении размера налоговой базы по налогу на доходы физических лиц имеет право на получение имущественных налоговых вычетов в суммах, полученных налогоплательщиком в налоговом периоде от продажи жилых домов, квартир, комнат, включая приватизированные жилые помещения, дач, садовых домиков или земельных участков и долей в указанном имуществе, находившихся в собственности налогоплательщика менее трёх лет, но не превышающих в целом 1 000 000 руб., а также в суммах, полученных в налоговом периоде от продажи иного имущества, находившегося в собственности налогоплательщика менее трёх лет, но не превышающих в целом 250 000 руб.
Таким образом, при продаже земельных участков НК РФ не предусматривает их разграничения на категории и виды разрешённого использования.
Учитывая изложенное, при продаже земельных участков сельскохозяйственного назначения, находившихся в собственности налогоплательщика менее трёх лет до их продажи, налогоплательщик, по мнению Минфина, вправе получить имущественный налоговый вычет в размере 1 000 000 руб.
Такое разъяснение содержится в Письме Минфина России от 30.12.2011 № 03-04-05/7-1140.