С 2 сентября 2010 года вступили в силу изменения в НК РФ, касающиеся размера штрафа за несвоевременную сдачу декларации. При этом было установлено, что к правонарушениям, ответственность за которые наступила после вступления в силу поправок, необходимо применять новый размер штрафа. Но при условии, что он меньше того, который был бы определён по старой редакции НК РФ.
Минфин России в Письме от 20.07.2011 № 03-02-08/82 сообщил, что взыскание ранее применённых налоговых санкций за правонарушение со дня вступления в силу поправок может быть произведено лишь в части, не превышающей максимального размера санкций, предусмотренных за такое правонарушение частью первой НК РФ в новой редакции.