Подпунктом 2 п. 1 ст. 238 и абз. 10 п. 3 ст. 217 НК РФ предусмотрено, что при оплате работодателем расходов на командировки работников как внутри страны, так и за её пределы не подлежат налогообложению суточные, выплачиваемые в соответствии с законодательством Российской Федерации, а также фактически произведённые и документально подтверждённые расходы по найму жилого помещения.
Оплата питания работника, стоимость которого отдельно выделена в стоимости проживания, не является возмещением расходов по найму жилья.
Следовательно, суммы такой оплаты облагаются ЕСН и НДФЛ в общем порядке.
Об этом говорится в Письме Минфина России от 14.10.2009 № 03-04-06-01/263.