Сумма налога на доходы физических лиц, исчисленного и удержанного с доходов работников обособленного подразделения, должны быть перечислены головной организацией в налоговые органы по месту учёта такого обособленного подразделения.
Разъяснение по этому поводу содержится в Письме Минфина России от 05.06.2009 № 03-04-06-01/127.