При совмещении различных режимов налогообложения организациями, являющимися налогоплательщиками единого налога на вменённый доход, рекомендуется определять доходы по видам предпринимательской деятельности, переведённым на уплату указанного налога, на основании данных бухгалтерского учёта с учётом положений статей 249, 250 и 251 НК РФ.
При этом следует иметь в виду, что согласно п. 7 ст. 346.26 Кодекса налогоплательщики ЕНВД, осуществляющие наряду с предпринимательской деятельностью, подлежащей налогообложению единым налогом на вменённый доход, иные виды предпринимательской деятельности, обязаны вести раздельный учёт имущества, обязательств и хозяйственных операций в отношении предпринимательской деятельности, подлежащей налогообложению ЕНВД, и предпринимательской деятельности, в отношении которой налогоплательщики уплачивают налоги в соответствии с иными режимами налогообложения.
Таким образом, сумма аванса, полученная от покупателя за товар, реализуемый в рамках деятельности, облагаемой ЕНВД, должна учитываться в составе доходов, полученных от осуществления предпринимательской деятельности, переведённой на систему налогообложения в виде ЕНВД.
Такое разъяснение содержится в Письме Минфина России от 17.06.2010 № 03-11-06/3/85.