Основания и порядок возврата или зачёта государственной пошлины определены ст. 333.40 гл. 25.3 НК РФ.
В случае если организация обратилась в уполномоченный орган с заявлением о предоставлении (переоформлении, продлении) лицензии в отношении деятельности по производству и обороту этилового спирта, алкогольной и спиртосодержащей продукции и лицензирующим органом было принято решение об отказе в предоставлении (переоформлении, продлении) лицензии, то уплаченная сумма государственной пошлины возврату не подлежит.
Об этом сообщил Минфин России в Письме от 09.06.2010 № 03-05-04-03/62.