Если организация перечислила аванс и получила в счет этого аванса товары до 1 октября 2014 г., то она должна была после осуществления вычета по НДС со стоимости товаров восстановить принятый ранее к зачету НДС с суммы аванса. Причем, в соответствии с действовавшим в тот период порядком (абз.3 подп. 3 п. 3 ст. 170 НК РФ) восстановить следовало НДС с суммы всего аванса, даже если он был зачтен в счет оплаты товаров по условиям договора лишь частично. Однако с 1 октября 2014 г. изменился порядок восстановления НДС, принятого к вычету с суммы выплаченного налогоплательщиком аванса. Изменения в абз. 3 подп. 3 п. 3 ст. 170 НК РФ были внесены Федеральным законом от 21.07.2014 № 238-ФЗ. Теперь восстанавливать следует НДС не со всего аванса, а лишь с той части, которая зачтена в счет оплаты товаров по условиям договора. Вопрос: нужно ли организации повторно восстанавливать НДС, если оставшаяся часть аванса зачтена в счет оплаты товаров после 1 октября?
Нет, не нужно. Новый порядок восстановления НДС применяется только в отношении товаров, работ и услуг, реализованных начиная с 1 октября 2014 г. Если же налогоплательщик уже восстановил НДС с суммы аванса до 1 октября согласно действовавшему ранее порядку, повторно это делать не нужно. Такие разъяснения содержатся в письме Минфина России от 28.11.2014 № 03-07-11/60891.