Российская организация, уплачивающая физическому лицу арендную плату за арендуемое у него помещение, признаётся налоговым агентом в отношении таких доходов физического лица и, соответственно, должна исполнять обязанности по исчислению, удержанию и перечислению в бюджет налога на доходы физических лиц в порядке, предусмотренном ст. 226 НК РФ.
Такие разъяснения содержатся в Письме Минфина России от 07.10.2009 № 03-04-06-01/257.