В Письме от 09.08.2011 № 14-05-18/24 Минфин России пояснил, что возмещение расходов по служебной командировке в соответствии со ст. 168 ТК РФ производится только работникам организаций, которые не финансируются за счёт средств федерального бюджета. То есть положения ст. 168 ТК РФ не распространяются на военных и гражданских государственных служащих, правовой статус которых урегулирован соответствующими федеральными законами. Суточные для госслужащих установлены в размере 100 руб., а возмещение расходов на оплату жилья производится им исходя из лимита в 550 руб. (Постановление Правительства РФ от 02.10.2002 № 729).
В то же время Постановлением Правительства РФ от 01.02.2011 № 43 руководителям некоторых военных и гражданских ведомств предоставлено право устанавливать своим сотрудникам суточные, возмещаемые за счёт ассигнований из федерального бюджета, в размере, не превышающем 300 руб.
Расходы по найму жилья согласно Постановлению Правительства РФ от 21.06.2010 № 467 возмещаются отдельным категориям военных и гражданских служащих по фактическим затратам на одно- или двухместный номер (в зависимости от ранга чиновника).
В настоящее время финансовое ведомство проводит работу по выработке предложений для внесения изменений в законодательство РФ в части порядка установления размеров возмещения расходов, связанных со служебными командировками госслужащих, а также приведению Постановления Правительства РФ № 729 в соответствие с этими изменениями.