С 1 января 2007 г. налоговая база по доходам, полученным от реализации ценных бумаг, может быть уменьшена только на сумму документально подтвержденных расходов, связанных с приобретением, реализацией и хранением ценных бумаг, в том числе на сумму, уплаченную регистратору, и сумму комиссионных, в случае документального подтверждения указанных расходов. Расходы по приобретению ценных бумаг принимаются в уменьшение налоговой базы в сумме фактически произведенных затрат, подтвержденных платежными документами. При этом имущественный налоговый вычет не предоставляется.
В случае реализации ценных бумаг, полученных в обмен на приватизационные чеки (ваучеры), в качестве расходов на приобретение указанных ценных бумаг может рассматриваться их рыночная стоимость на момент обмена на приватизационные чеки (ваучеры).
Такие разъяснения содержатся в Письме Минфина РФ от 27.02.2008 № 03-04-05-01/34.