Организация, воспользовавшаяся правом на включение в состав расходов, учитываемых при налогообложении прибыли, амортизационной премии, при переходе на упрощенную систему налогообложения определяет остаточную стоимость основных средств в виде разницы между первоначальной стоимостью основных средств, уменьшенной на сумму капитальных вложений на их приобретение (10%), и суммой амортизации, начисленной в порядке, установленном ст. 259 НК РФ. Основанием для этого являются подп. 3 п. 3 ст. 346.16, п. 2.1 ст. 346.25 НК РФ и п. 1.1 ст. 259 НК РФ.
Такие разъяснения дал Минфин России в Письме от 13.09.2006 № 03-11-04/2/192.