Минфин РФ в Письме от 14.08.2007 № 03-07-15/120 разъяснил, что суммы НДС, ранее правомерно принятые к вычету по имуществу, выбывшему без выявления виновных лиц (в связи с потерей, порчей, боем, хищением, стихийным бедствием и др.), необходимо восстановить.
При этом восстановление следует производить в том налоговом периоде, в котором недостающее имущество списывается с учета. По амортизируемому имуществу восстановлению подлежат суммы налога в размере суммы, пропорциональной остаточной (балансовой) стоимости имущества без учета переоценки.