Генеральная прокуратура выявила грубые нарушения законодательства при реализации проекта создания инновационного центра «Сколково». Как говорится в материалах, размещенных на официальном сайте ведомства, одноименный фонд не обеспечил должное организационное руководство и координацию деятельности по реализации проекта, что способствовало бесконтрольному расходованию средств, а также причинению ущерба фонду и интересам государства.
Генпрокуратура России проверяла деятельность Фонда «Сколково» с апреля по август 2013 г. В частности, ревизоры подсчитали, что опережающее финансирование и отсутствие порядка использования (инвестирования) временно свободных денежных средств привели к тому, что более 22 млрд руб., полученных из федерального бюджета, фонд размещал на депозитах, направлял на приобретение векселей (ценных бумаг) по процентной ставке значительно ниже ставки рефинансирования Центрального банка РФ.
Вместе с тем отсутствие со стороны руководства Фонда «Сколково» должного контроля при реализации проекта способствовало бесконтрольному и расточительному расходованию средств в ущерб интересам государства. Так, 1 марта 2012 г. Фонд заключил два договора на создание рекламных видеоматериалов продолжительностью 60, 30 и 10, общей стоимостью 54 млн руб. Согласно проведенному исследованию рыночная стоимость выполненных работ не превышает 5 млн руб. В результате завышения цены договоров Фонду причинен ущерб в сумме 49 млн руб.
В нарушение ч. 1 ст. 6 Закона без определения порядка привлечения третьих лиц Фонд расточительно и бессистемно расходовал средства на оплату оказанных ими услуг. В период 2010—2012 гг. заключено более 200 договоров на сумму свыше 600 млн руб.
Например, юридическому лицу оплачены услуги по разработке системы ключевых показателей эффективности работы на сумму 6 млн руб., которые согласно приказу президента Фонда от 24.02.2012 должен разрабатывать департамент по стратегическому планированию и анализу.
Фирме за работу «Социологическая модель социальной среды „Сколково“, по содержанию идентичную диссертации Дулиной Н.В. «Социально-пространственная модификация современного российского крупного города», выплачено 2,7 млн руб.
По заключениям эксперта на 16 млн руб. завышена стоимость услуг по восьми договорам с физическими лицами в области образования, о проведении семинаров, по содействию руководству в развитии инфраструктуры Центра, по анализу деятельности Фонда.
Еще одно нарушение, на которое указали прокуроры — около 2,1 млрд руб. в нарушение условий грантовых соглашений было отвлечено от научной деятельности и в целях извлечения дохода размещено на депозитных счетах. Полученные в виде грантов денежные средства перечислялись в виде беспроцентных займов, в том числе аффилированным организациям.