При получении аванса плательщик НДС должен начислить НДС и оформить счет-фактуру (п. 3 ст. 168 НК РФ). На основании этого счета-фактуры после реализации товаров (выполнения работ, оказания услуг), в счет оплаты за которые был перечислен аванс, налогоплательщик имеет право принять начисленный ранее налог к вычету (п.1 ст. 169, п. 8 ст. 171 и п. 6 ст. 172 НК РФ). Минфин России в письме от 19.09.2014 № 03-07-09/46986 напомнил, что при оформлении счета-фактуры на аванс необходимо указывать номер платежно-расчетного документа, на основании которого была получена предоплата (подп. 3 п. 5.1 ст. 169 НК РФ) и дал некоторые пояснения относительно этого номера.
Согласно Приложению № 1 Положения о правилах осуществления перевода денежных средств, утвержденного Банком России от 19.06.2012 № 383-П, в реквизите «N» платежного поручения должен стоять номер цифрами, отличный от нуля. Если же значение этого реквизита состоит более чем из трех цифр, документ идентифицируется по трем последним разрядам номера, которые должны быть отличны от «000» (п. 4.2 Положения о платежной системе Банка России, утвержденного Банком России от 29.06.2012 № 384-П). На этом основании специалисты финансового ведомства сделали вывод, что трехзначный номер платежного поручения в счете-фактуре на аванс не является основанием для отказа в вычете налога по данному документу.