Передача имущественных прав в уставный капитал дочерней организации признается объектом обложения НДС.
При этом, поскольку такая передача носит инвестиционный характер и, по сути, не является реализацией товаров (работ, услуг), к такой операции применяются нормы, установленные в подп. 1 п. 3 ст. 170 НК РФ. То есть, при передаче имущественных прав в уставный капитал дочерней организации суммы НДС, ранее принятые к вычету по передаваемым имущественным правам, подлежат восстановлению у передающей стороны. Сумма восстановленного НДС не включается в стоимость передаваемых имущественных прав, но указывается в документах, которыми оформляется передача. Указанные суммы НДС подлежат налоговому вычету у принимающей стороны.
Такие разъяснения содержатся в Письме Минфина от 18.09.2008 № 03-07-07/93.