Надбавки за вахтовый метод работы являются компенсационными выплатами, установленными законодательством РФ.
При этом, если такие выплаты установлены локальным нормативным актом организации, они не подлежат обложению НДФЛ на основании п. 3 ст. 217 НК РФ и ЕСН на основании подп. 2 п. 1 ст. 238 НК РФ.
Об этом Минфин сообщил в Письме от 19.02.2009 № 03-04-06-01/34.