В определенных п. 1 ст. 342 НК РФ случаях налогообложение добытых полезных ископаемых производится по ставке 0%, потери полезных ископаемых НДПИ не облагаются. Нормативы утверждаются ежегодно МПР совместно с Ростехнадзором.
Налоговые органы на практике часто начисляют НДПИ исходя из срока действия уточненных нормативов, отсчитывая его с момента утверждения МПР. Однако Минприроды указало, что период действия нормативов — с 1 января по 31 декабря рассматриваемого года (Письмо ФНС РФ от 10 февраля 2005 г. № 21-2-05/9, Письмо МПР от 12 января2005 г. № ВС-58-42/39).