Соглашение подписано 12 декабря 2008 г. в Москве. Оно закрепляет функции Секретариата как рабочего органа Комиссии Таможенного союза, осуществляющего организацию работы Межгосударственного Совета Евразийского экономического сообщества (ЕврАзЭС), Комиссии Таможенного союза, а также их информационно-техническое обеспечение.
Определяются функциональные особенности и организационная структура Секретариата. Регламентируется порядок набора персонала, специфика деятельности сотрудников Секретариата, вопросы, касающиеся трудовых отношений, пенсионного обеспечения и пособий по социальному страхованию.