В письме от 06.09.2012 № АС-4-3/14870@ ФНС России разъяснила, что аптечные организации, изготавливающие лекарственные средства по рецептам на лекарственные препараты и требованиям медицинских организаций, не признаются плательщиками акцизов. Ведь подп. 2 п. 1 ст. 181 НК РФ установлено, что лекарственные средства (включая гомеопатические препараты), изготавливаемые аптечными организациями по рецептам на лекарственные препараты и требованиям медицинских организаций, разлитые в емкости в соответствии с требованиями нормативной документации, согласованной уполномоченным федеральным органом исполнительной власти, подакцизными товарами не признаются. Поэтому обязанность уплачивать в бюджет авансовый платеж акциза по алкогольной и (или) подакцизной спиртосодержащей продукции, прописанная в п. 8 ст. 194 НК РФ, не распространяется на аптечные организации, изготавливающие такие лекарственные средства.
Отметим, что позиция налоговиков согласована с Минфином России, а письмо размещено на официальном сайте ФНС России в разделе «Разъяснения ФНС, обязательные для применения налоговыми органами».