Законопроект подготовлен во исполнение поручения Президента РФ. Предлагается установить уровни террористической опасности, предусматривающие принятие дополнительных мер по обеспечению безопасности личности, общества и государства, которые будут касаться деятельности федеральных органов государственной власти, органов государственной власти субъектов РФ и органов местного самоуправления, принимающих участие в противодействии терроризму.
Предлагается установить следующие уровни террористической опасности: повышенный («синий»), высокий («желтый») и критический («красный»). Право определять порядок их установления и содержание дополнительных мер предоставляется Президенту РФ. Дополнительные меры, ограничивающие права и свободы граждан при объявлении уровней террористической опасности не предусматриваются.
Предлагается возложить руководство контртеррористической операцией на должностное лицо, принявшее решение о её проведении, и установить, что в период проведения контртеррористической операции её руководство может быть возложено на иное должностное лицо только руководителем федерального органа исполнительной власти в области обеспечения безопасности. Вводится запрет на вмешательство любого другого лица, независимо от занимаемой им должности, в управление подразделениями, входящими в состав группировки сил и средств, с момента, когда руководителем контртеррористической операции отдано боевое распоряжение (боевой приказ) о её проведении.